تحلیل "pseudotime" یا "زمان کاذب" چیست؟🔹 تحلیل "زمان کاذب" یکی از روشهای بسیار مهم در تحلیل دادهه…
انتشار: 2026/07/19 07:31 UTCدریافت: 2026/08/07 00:00 UTCآخرین مشاهده: 2026/08/07 00:00 UTC
تحلیل "pseudotime" یا "زمان کاذب" چیست؟🔹 تحلیل "زمان کاذب" یکی از روشهای بسیار مهم در تحلیل دادههای single-cell و به معنی بازسازی مسیر "زمانیِ" تمایز یا تغییر سلولها بر اساس شباهتهای بیان ژن، بدون اینکه زمان واقعی ثبت شده باشه است.🔹 چرا بهش میگن زمان کاذب؟چون ما زمان واقعی نداریم (مثلاً نمیدونیم فلان سلول دقیقاً چند ساعت پیش شروع به تمایز کرده)، ولی میخوایم ترتیب تغییرات سلولی رو حدس بزنیم. بنابراین، با الگوریتمهایی، سلولها رو در یک مسیر فرضی زمانی قرار میدیم که نشون بده چه سلولی زودتر و کدوم دیرتر به حالت نهایی رسیده.📌 ابزارهای معروف این نوع تحلیل:🔹 Monocle🔹 Slingshot🔹 SCORPIUS🔹 PAGA (in scanpy)#آنالیز_داده ----------🆔 @BioinfCamp
تاریخچه بازدید مشاهدهشده
حدود 1 بازدید تازه در ساعت در این نمونهپستهای تلگرام — کمپ بیوانفورماتیک
💥 تنوع مردم آسیا در سلولهای ایمنی انسان💎 از سری پستهای پایگاهِ خبری کمپ بیوانفورماتیک!!!💎 لطفا برای مطالعه این مطلب علمی بر روی لینک زیر کلیک کنید 👇💎 ResBio Post - Click Here#مقاله #بیوانفورماتیک ----------🆔 @BioinfCamp
🔹 دیروز یه سوال پرسیدیم که جوابش نرمالسازی دادهها بود.🔹 دادهها رو قبل از آنالیز نرمال میکنیم چون وقتی مقیاسها یا پراکندگیها خیلی متفاوت باشن، مدلها و تحلیلها نمیتونن درست یاد بگیرن یا نتایج خوبی بدن.🔹 بعد از نرمالسازی، دادهها روی یک مقیاس مناسب قرار میگیرن و تحلیلها دقیقتر و قابل اعتمادتر میشن.#آنالیز_داده ----------🆔 @BioinfCamp
🔹 به نظر شما روی این دادهها چه کاری انجام شده که چنین تغییری در توزیعِ آنها ایجاد شده؟ 🧐🔹 چرا تو آنالیز دادهها این کار رو انجام میدیم؟🔹 چرا دادههای خام معمولاً در آنالیز، خروجیها و نتایج دقیق و قابل اعتمادی ارائه نمیدهند، اما پس از انجام این تغییر، تحلیلها پایدارتر، قابل مقایسهتر و قابل اعتمادتر میشوند؟#آنالیز_داده ----------🆔 @BioinfCamp
معرفی G&T-seq Genome and Transcriptome sequencing یک روش تکسلولی (single-cell) برای تحلیل همزمان DNA و RNA است که به محققان اجازه میدهد تا ارتباط بین DNA و RNA در سطح یک سلول را بررسی کنند.🔹 هدف اصلی:فهم تغییرات ژنتیکی (مانند جهشها، کپی نامبر تغییرات CNVs) و بیان ژنی (transcriptional profile) در یک سلول.کاربرد در مطالعه تنوع سلولی، سرطان، توسعه سلولی، و بیماریهای ژنتیکی.🔹 روش کار:ابتدا سلول منفرد جداسازی میشود.سپس DNA و RNA از یکدیگر جدا شده و جداگانه توالییابی میشوند.در مرحله بعدی RNA-seq برای بررسی بیان ژنی و DNA-seq برای بررسی ژنوم سلول استفاده میشود.🔹 ویژگیها:امکان بررسی همزمان ژنوتیپ و فنوتیپ سلولی.توانایی شناسایی همبستگی بین جهشهای ژنتیکی و الگوهای بیان ژنی.روش نسبتاً پیچیده و نیازمند تجهیزات پیشرفته برای جداسازی و آمادهسازی نمونهها.#آنالیز_داده ----------🆔 @BioinfCamp
معرفی Nano Banana 🍌🔹 یک ابزار هوش مصنوعی برای ویرایش و ساخت تصویر با استفاده از توصیف متنی!🔹 با Nano Banana میتونی عکسها رو بدون نیاز به مهارت طراحی یا فتوشاپ، فقط با نوشتن یک متن، تغییر بدی یا تصویر جدید بسازی. nanobananaimg.com/#%D9%85%D8%B9%D8%B1%D9%… ---------- 🆔 @BioinfCamp
لنفوسیتهای داخلاپیتلیالی یا IEL (Intraepithelial Lymphocytes)نوعی سلول ایمنی هستند که بین سلولهای اپیتلیال روده باریک قرار دارند.ویژگیها:🔹 عمدتاً از نوع T lymphocyte هستند.🔹 نقش مهمی در حفظ ایمنی مخاطی دارند.🔹 اولین خط دفاعی در برابر آنتیژنها و عوامل خارجی (مثل ویروسها، باکتریها و پروتئین گلوتن) محسوب میشوند.#دانستنیها ----------🆔 @BioinfCamp